经系统的紊乱和大脑的关联是密不可分的，人脑是接收脑外界信息、产生感觉、进行逻辑推理和思维、发出指令产生行为的总司令部。它有着为发达的处理系统，可支配人体的思维、感觉、语言、情绪、运动等高级活动的运转，是人体接收内外环境信息获取、存储、处理、加工和调节的中心。

固元醒神方剂指出植物神经紊乱的病因般是由内因和外因两方面的原因。“内因是变化的根据，外因是变化的条件，外因只能通过内因起作用” 这是句哲理，也是事件变化发展的客观规律之。打个比喻鸡蛋因得适当的温度而变化为小鸡，但温度不能使石头变为鸡子，因为二者的根据是不同的，就是这个道理。

【外因】外因多由长期持久的精神刺激或精神压力导致。如体力劳动，睡眠不足，家庭纠纷、恋爱挫折、事业失败或人际关系紧张，持久的脑力，对外界刺激耐受性差，应付能力以及适应环境的能力不足。

【内因】内因主要就是脏腑功能失导致的，心为君主之官，心有藏神，主身之血脉，主神明：心属五脏六腑的大主，生命运转之根本，心主属统帅的作用。所有内外事物感皆传于心，如果心神常常处于过分动乱而打破阴阳平衡的的状态时就会引起疾病。如心神过于躁动，神不内守，乱而不定，不仅导致不寐症，还必然扰乱脏腑，耗气伤精。长期刺激大脑，因心脑相系的关系，会导致心阴阳失调五脏不和，心血上供于脑不足，脑失营养从而引起大脑这个司令部的指挥混乱发出错误指令。

植物神经紊乱属于内脏功能紊乱综合征。《难经》曰：“五脏有七神，各何所藏那？指出五脏所藏：肝藏魂，肺藏魄，心藏神，脾藏意与智，肾藏精与志”。中医以五脏六腑辩证其根本原因。

【肝肾辩证】人身上升之气自肝而出。也就是说人的切活动，都是肝气升发之后，变幻而为。然而人身之气根于肾，元气之根是两肾之间的命门，肝气实质上由此而提取，逐步经五脏六腑，上达头颠，并旁通于四肢百骸。中医总讲乙癸同源，肝肾同治，实质即本于此。许多植物神经紊乱病的病机实质上就是肝气疏泄失职造成的。

【胃肺辩证】肺主肃降，肺主气。然而主下降者，肺胃也。中焦之上，气分，肺主之;气至于中焦，胃中水谷精华之气，被是吸收之后，糟粕之物，是有形的东西，它的排出，要靠胃气的下降的能力。肝脾主升发，生发之机正常，人有活力；肺胃主肃降，肃降之机正常，人体之中的各种废物，可以很畅顺的被排出体外。

人身之气，升降不息，如环无端，不被邪气阻扰，则人体康健；人体之气机，受到风寒暑湿燥火的外邪，以及喜悲思忧恐惊怒等七情的干预，气机必然紊乱，气机紊乱，则病生。

【心肾辩证】夫心主血而藏神，肾主志而藏精者也。以先天生成之体论，则精生气，气生神；以后天运用三之主宰论，则神役气，气役精。精，气，神，养生家谓之三宝。治之原不相离，故于滑精，梦泄种种精病者，必本于神治；于怔忡，精悸种种神病者，必本于气治。盖安神必益其气，益气必补其精。

固元醒神方剂认为植物神经紊乱病起于七情（喜、怒、忧、思、悲、恐、惊），不比于外感易治，此症多为虚症，其次为虚实互见之证，而纯实证较少。常因未对症治疗导致反反复复。如虚不受补，补则痰火加重，用攻的方法，则气血变得更加亏虚。用温补则虚火易生，用寒凉，则脾胃受伤。正解应从整体、脏腑出发，从疾病的源头出发，辩证求因、审因论治，再以养五脏元气，调七情安心神才会没有弊端。